本作的故事紧接《秋之回忆3：想君》中荷岛深步线的Bad Ending。在雨夜中，男主角加贺正午面临着人生中最艰难的一次抉择：深步因梦想受挫而黯然离去，他究竟是该追上去，还是就此放手？
如果选择不追，深步可能会从此一蹶不振；如果选择去追，又能否让她相信奇迹会发生？玩家的选择将决定故事的走向，并最终导向不同的结局。
游戏的故事主要围绕正午与深步的感情纠葛展开，核心主题是让深步相信奇迹的存在，并证明她并非大家的“包袱”。后续剧情中，玩家将面临更多抉择，不同的选择将直接决定能否达成Good Ending。